1999年7月7日、熊本県八代地区に出現した幻獣の一群を迎え撃った5121部隊。
PBE攻撃に巻き込まれかけた速水厚志らは謎のHWTに助けられる。
そのHWTのパイロットこそ、芝村グループ会長の娘、芝村舞であった。
芝村はその翌日、5121部隊に配属される。
生真面目な芝村は、一見浮かれている人間が多い5121部隊になじむことが出来ず、一部メンバーとは度々衝突もするが、メンバーたちはそんな芝村を温かく迎え、芝村も次第に5121部隊に慣れ親しむようになっていった。
やがて、芝村は複座型HWTのパイロットに任命され、速水とコンビを組むこととなる。
最初は息の合わなかった二人だが、五木村への出動で幻獣の群れに包囲された時、互いの境遇について初めてじっくりと話し合い、わだかまりをなくしていく。
速水の機転によって無事帰還し、これを期に二人の仲は急接近していった。
相思相愛ながら、互いに思いを告白できない二人をじれったく思った5121部隊の他のメンバーはその仲を一気に進展させようとするが……。